这是又一部关于时间、空间和人性的哲学命题动画。日本动画所特有的那种创造离奇而宏大世界观的做法，在本作中再次得到淋漓尽致的体现。如果你是一个逻辑能力较弱的人，或许真的很难看懂影片中关于时间线的种种匪夷所思的设定，但是你依然能体会当人类通过时间机器穿越时空时所带来的种种伦理难题。“命运石之门”起始于2009年的一款游戏，后被改编为电视动画，今年推出了这部剧场版。
距离与维克特路基艾尔的决战已经过了一年，光（根岸拓哉 饰）结束了一年的海外进修，回到了日本。此时，咲夜（小池里奈饰）和玛娜（最上もが饰）也一起加入了UPG，组成了新生UPG。然而，和平却没能一直持续下去，雫丘的上空突然出现了谜样的时空城，以及呼喊着“封印所有奥特曼”的超时空魔神艾塔鲁伽和女战士阿蕾娜（小宫有纱饰）。银河和维克特利同UPG一起与艾塔鲁伽、阿蕾娜展开了战斗，但却遭遇了苦战。 战斗中，从别的宇宙赶来的青年春野武藏（杉浦太阳饰）和赛罗奥特曼出现了。为了打倒艾塔鲁伽，赛罗给光、胜（宇治清高饰）进行了特训。UPG也为了解救被封印的奥特曼，和武藏一起突入进了时空城…
