本片描述了香港反黑组的组员惩治罪恶的英勇事迹以及他们个人感情经历的点点滴滴。人称“筋肉人”的反黑组探员阿喜（吴毅将 饰）立功无数、屡破奇案，但却因脾气倔犟，向来专横而和同事们诸多不顺。刚刚加入的康仔（陈浩民 饰）更是对阿喜诸多怨言，甚至想申请调组。后来一起办案多了，反黑组内部终于彼此了解，一团和气。反黑组内也有不少情事，一次上司阿凡（黎耀祥 饰）结识了卖鱼女阿娇，两人成了欢喜冤家；而阿弟（邵美琪 饰）更是一直暗恋阿喜，他们在工作上、感情上正经历着一次又一次的考验。
颜一一和秦御几经生死，产生了深深的感情，特别是突发的疫情让他们认清了自己的内心，决心冲破一切困难相爱相守，但书中世界被严重改变，秦御又意外重伤，生命垂危。为了心上人，颜一一不得不忍痛回到了现实世界。
该剧以三大战役为背景，塑造了以柴福东为首的共军特工队和以马伯驹为首的国民党军统之间的殊死较量。《冷枪手》集谍战、枪战、夺宝等精彩元素于一体，突出表现了特工队的成员们的才智，众心如城为完成民族大义。
故事发生在抗日战争时期和解放 后中苏珍宝岛战争开始前一个时期的 东北边境黑虎镇一带，围绕中苏情报 员与敌斗智斗勇、烈士后代寻找抗联 地下组织中出卖父辈的叛徒展开。
