《庚子风云》讲述的是公元1900年及中国历庚子年，八国联军攻占北京，并占领紫禁城，皇太后慈禧为避祸携光绪帝、大阿哥等人仓惶逃离皇宫，来到西安，最后又安全回宫的故事。 慈禧太后临行前，由于政治立场不同的仇恨，将光绪皇帝深爱的妃子珍妃推入井中杀害。而当太后历尽千难万险来到古都西安时，却发现当地戏班的花魁白牡丹竟和珍妃长得一模一样！而这位本名斯琴的白牡丹却与在慈禧太后等人逃难至西安这条西行路上，给予了他们莫大帮助的一位从欧洲留洋五年回国的爱国青年陈然有着夙世姻缘，同时她也和陕西巡抚韩雨轩同样有着千丝万缕的关系。
张大光和张耀祖两父子，在港经营的山寨厂出现困难，遂决定回乡设厂，岂料被骗，幸得大陆女工李彤相助才能逃回香港。后耀祖再次觅得机会到深圳特区设厂，并邀李彤帮忙管理工厂，自此二人感情一日千里，最后更冲破中港障碍结成夫妇。岂料婚后，耀祖在港邂逅姚昭然，二人互相吸引，耀祖在李彤与昭然之间，难以取舍… 另一方面耀祖的好友兼姐夫陈荣昌得上司赏识到深圳的工厂当经理，却与秘书有染，其妻张美华得知后因而大受刺激，竟想到要毒杀全家…
