《机动战士高达 THE ORIGIN》系列的第6作。继续讲述了因父亡故而变成孤儿的卡斯巴尔与阿尔黛西亚，在动荡大时代的洪流之中，面临的又一场人生巨变……标题中的“赤色彗星”便是夏亚·阿兹纳布尔的称号。由于夏亚的机体无论是扎古、大魔，还是后来的沙扎比等都是红色的，夏亚操纵 这些机体风骚地驰骋在战场上，故被敌人称作“赤色彗星”。
万物皆有灵，自然之力汇聚成了各种拥有意识的仙子。但是，由于人类不爱惜自然更有被封禁的力量觉醒，仙子们受到了伤害。人类少女遇到了来自水底的仙子，并与他相知多年。但是两人却无法跨越仙、人之隔。少女在奇妙的旅途中，决心寻找属于自己的力量。她相信人类也是自然的一环，定有人与自然和谐共存之法。她能否守护自然？
在顾迟母亲的葬礼上，姜澜以“姐姐”的名义收养了没人愿意照顾的顾迟，成为顾迟黑暗人生中的一束光。顾迟也逐渐喜欢上了这个漂亮“姐姐”。年龄的隔阂是否会阻碍两人感情的发展，面对“弟弟”的表白，霸气的“姐姐”将如何应对？
