新一任龙骑侠，送花少年果果曾经在好朋友的帮助下封印了邪恶的黑都督。过久了平淡无奇的生活，果果的内心又开始躁动起来，然而追求速度和力量的他只能将一腔英雄热血用在与舅舅斗智斗勇上。伴随着一场离奇的大火，一个叫嘀嗒的水精灵彻底颠覆了他的生活，新的冒险也因此展开。 果果再次召集老搭档妙妙和小头四，一起勇闯神秘的水精灵工厂，却发现精灵工厂看似地上天宫般繁华兴荣的背后，其实隐藏着可怕的秘密！面对热情好客的火魔和行踪成谜的精灵印哥，究竟谁才是工厂真正的主人？而等待果果的是误会一场还是生死未卜的宿命对决？曾经可爱胆小的小火苗又是如何变成狂妄自傲的大火魔？难道真相的背后还隐匿着更多不为人知的神秘力量？这一切纷争和谜底都等待着龙骑侠果果用心灵的智慧一一揭晓。 野心勃勃的幕后黑手步步为营，请君入瓮，果果陷入生死危机！他和伙伴们能否解开心结，让清冽可口的泉水再次流淌在水之洲美丽的山川之中？虽然成长伴随着无限的烦恼，但是少年英雄龙骑侠必定会在艰险的旅途上，再次证明自己可以用爱和勇气改变整个世界！
主角·城茂的朋友沼田五郎为邪恶组织·黑撒旦所杀，为了复仇，城茂只身潜入黑撒旦的基地，并假装自愿接受改造手术，成为电气人。但因为手术时城茂偷偷拿掉催眠装置，所以他并未被洗脑。在向大首领宣誓的时侯，城茂趁机逃脱。 在逃脱的时侯，城茂救出了被改造成电波人的岬百合子，之后两人便与黑撒旦和迪鲁扎军团的奇械人、改造魔人展开了战斗。
西暦2199年、地球は宇宙人・ガミラス帝国の侵略を受けていた。ガミラスは冥王星に前線基地を建設し、地球に対して遊星爆弾による無差別攻撃を加えていた。海は蒸発し地球は赤茶けた姿に変貌し、放射能汚染で地上の生物は死滅する。人類は地下都市を建設し、地球防衛軍を結成して抵抗を続けていたが、科学力の差の前になす術もなく、地下にも放射能汚染が進行し、人類の絶滅まであと一年余りと迫っていた。 最後の地球防衛艦隊が、冥王星空域でのガミラス宇宙艦隊との交戦で壊滅し、人類生存の希望は完全に潰えたかに見えた。しかし、この海戦の最中に外宇宙から飛来した一隻の宇宙船が火星に不時着、通信カプセルが回収される。その中にはイスカンダルから、「放射能除去装置・コスモクリーナーDを受け取りに来るように」との救援メッセージと、航海に必要な波動エンジンの設計図が納められていた。極秘裏に宇宙戦艦へと改造中だったヤマトに波動エンジンが搭載され、目的が地球脱出から放射能除去装置・コスモクリーナーDの受け取りに変わる。 14万8千光年の彼方、大マゼラン星雲のイスカンダル星に向け、1年以内に帰還しなければ人類滅亡という状況下、宇宙戦艦ヤマトは人類最後の希望を託されて発進する。 ヤマトはガミラス帝国と戦い、未知の宇宙空間における障害を乗り越えながら、イスカンダル星を目指して行く。
动画版的故事设定在2020年，讲述了某学校中学一年级的男学生们，集体在废弃工厂建立所谓的“解放区”，并发动了针对大人们的“叛乱”后的故事，借此反映了学生学业过重、学校对学生任意进行体罚等种种社会问题。
