《庚子风云》讲述的是公元1900年及中国历庚子年，八国联军攻占北京，并占领紫禁城，皇太后慈禧为避祸携光绪帝、大阿哥等人仓惶逃离皇宫，来到西安，最后又安全回宫的故事。 慈禧太后临行前，由于政治立场不同的仇恨，将光绪皇帝深爱的妃子珍妃推入井中杀害。而当太后历尽千难万险来到古都西安时，却发现当地戏班的花魁白牡丹竟和珍妃长得一模一样！而这位本名斯琴的白牡丹却与在慈禧太后等人逃难至西安这条西行路上，给予了他们莫大帮助的一位从欧洲留洋五年回国的爱国青年陈然有着夙世姻缘，同时她也和陕西巡抚韩雨轩同样有着千丝万缕的关系。
山大王马大有绑架公主江芊儿误遭雷击，神奇的互换了身体，甚至彼此感受相通，成为了命运共同体。江芊儿欲换回身体与相爱的少将军陆天行举办婚礼，马大有也想去为父亲复仇，两人不得不向现实妥协，共同合作，以应付各种难关。应王密谋造反，令人潜入马大有山寨，架空马大有，将山寨做为秘密屯兵之所。江芊儿为替马大有查清当年父仇真相，陆天行也要为皇帝寻找应王谋反的罪证，三人各怀目的住进了应王府。应王提前谋反，颠覆了朝廷，江芊儿顿时成为无家可归之人。陆天行也被投诚的父亲逼着迎娶应王女儿江可岚，以示忠诚。江芊儿与马大有陆天行三人为蒙骗过关，上演了一出啼笑皆非的三角关系。
