动画电影《银河宝贝》讲述的是一个在外太空的故事，在银河系中有一颗机器人的行星，叫哈帝星，由于哈帝星科技的高速发展，机器人这种消耗能源的群体将面临巨大危机，但是犀牛博士研究出了一种叫做“蒙多拉晶石”的宇宙物质能给哈帝星。
小康是无用之人，在车水马龙中高举广告招牌维生，即便狂风暴雨亦屹立不摇。他举牌、点烟、尿尿，再举牌、点烟、尿尿，任车阵喧嚣从身旁呼啸而过。小康的生命中只有两个孩子，他们一起吃饭、一起刷牙、一起更衣，一起蜷曲着入睡。他们缺乏水电，总是在同一张破旧床垫上，伴着一颗高丽菜相拥而眠。整座城市彷佛都成了野狗咆哮游荡的废墟，河流也更遥远了。一个暴雨交加的夜晚，小康决定带上两个孩子，一同出航。
故事继续于1945年9月，第二次世界大战刚刚画上句点，全世界都在欢欣鼓舞地迎接着久违的和平时光。此时的塞巴斯蒂安（菲利克斯·博叙埃 Félix Bossuet 饰）已经成长为了一名10岁的少年，他和小狗贝勒以及祖父萨塞尔（切基·卡尤 Tchéky Karyo 饰）一起居住在位于圣马丁的山寨之中。 两年前，塞巴斯蒂安最好的朋友安吉丽娜（玛格·夏特莉 Margaux Châtelier 饰）在战争中失踪了，她所乘坐的飞机坠毁在了阿尔卑斯山上的茫茫雪原之中。虽然所有的人都认定了安吉丽娜凶多吉少必死无疑，但塞巴斯蒂安还是不愿意放弃心中的希望。他找到了聪慧而又勇敢的飞行员皮埃尔（蒂埃里·钮维 Thierry Neuvic 饰），在后者的帮助之下，塞巴斯蒂安带着爱犬踏上了寻找好友之旅。
