在未来世界里，人类研发出了生理上与人类无异的仿生人，二者唯一差别就是可以被植入“初始执念”。由于该产业发展迅猛，有人开始利用其进行非法活动。政府最终出台“仿生人禁止令”。 政府成立“明眸搜查部”来配合搜查混迹在人类社会中未被发现的仿生人，调查员程诺（宋威龙 饰）和安秋（文淇 饰）在组长万国峰（祖峰 饰）的带领下展开工作。二人从开始的互看不惯到后来可以默契配合完成案件侦破。就在这个过程中，二人各自隐藏的秘密也渐渐浮出水面。
面对一个个错综复杂的悬疑案件，法证部高级化验师余星柏（黄宗泽 饰）、重案组高级督察井浩然（袁伟豪 饰）、法医科高级医生范佩清（蔡洁 饰）三人团将如何一步步抽丝剥茧，在危机四伏的谜团中，用科学揭露事实寻觅真相？在面临生死时，他们又将如何坚守本心，完成对自我和他人的救赎？一切答案都将在本季剧集中揭晓。
