仙之巅，傲世间，有我祖安就有天，天下剑仙三百万，遇我也需尽低眉，我为键仙自当镇压世间一切敌，谁在称无敌，哪个言不败？
紅葉みさき等四名少女是特殊部隊“セラフィム”的候补生，为了成为正式成员而在ウォッチャーズ ネスト闻鸡起舞。但是她们并不知道，真正的敌人异型生命体“グール”有多么可怕……
時は明治十一年。急速な欧米化に伴い、政府に不満を持つ人々が増え、監獄は囚人で埋まり、脱獄も後を絶たなかった。そこで政府は、滋賀県琵琶湖に重犯罪者専用の檻、日本最大・脱出不可能な湖の監獄、獄門処を設ける。その監獄への橋渡し人を請け負う曇家の三兄弟が織り成す大冒険活劇の幕が上がる……！
在防卫队长官·四之宫功的判断下，日比野卡夫卡逃过了被做成武器的命运，但依然处于被关押状态。在第三部队的新人们接到调动命令，纷纷赶赴各自要去往的新部队时，率领第一部队的最强者·鸣海弦出现在了卡夫卡面前。 鸣海表示不需要作为队员的卡夫卡，为了让他认可自己，卡夫卡必须直面“怪兽8号”那过于强大的力量。但与此同时，“怪兽9号”的威胁也在暗中逼近…
