舞台是近未来的日本，过着普通高中生生活的才贺淳贵听闻10年前便下落不明的父亲的遗体在岩手县黑神山的遗迹中被发现，便急忙赶赴那里。然而才贺在遗迹中却看到了不可思议的幻觉。他的手腕上出现了一个金色的腕轮，上面刻着神代文字“使用者 REIDEEN”。与此同时，巨大的陨石从空中落下、湖中出现了巨大的机器人……
某一日，人类平静的生活因为一种名叫“兽”的生物的侵袭而彻底画上了句号。当最后的人类威廉（新井良平 配音）从沉睡之中醒来时，他发现，已经500年过去了，而威廉的身上，承载了人类延续的最后的希望。 这个世界上能够和兽抗衡的，只有懂得如何使用圣剑的妖精，然而，这些妖精们将自己化为利剑，一旦能量耗尽就会面临死亡的悲惨结局。在命运齿轮的运转之下，威廉和妖精们相遇了。个性温柔体贴的珂朵莉（田所梓 配音）、沉默寡言我行我素的奈芙莲（上原明里 配音）、看上去懵懂无知其实高深莫测的艾瑟雅（Machico 配音）、率真直爽的菈恩托露可（荒浪和沙 配音），在她们的帮助之下，威廉能否夺回属于人类的领地呢？
“在人前唱歌什么的，我……”虽然想唱，但是唱不出来。 在家中闭门不出，默默持续歌唱的原圣歌队的出井天使。 在过着平凡校园生活的天使面前突然出现的原管弦乐队指挥响春男。原先平静的天使的日常生活，因与春男的相遇一下子变得混沌…！
