一对爱拌嘴的机器人兄弟要对抗嗜血怪兽，应对超自然灾难和个人琐事，还要适应成长过程中的各种试炼。
在纽约出现了一只神秘的数码兽，他利用自己特殊的力量将太一、阿和、阿空、光子郎、美美、阿丈带到了一个陌生的世界。同时，在纽约的八神光和高石武发现了这只数码兽，并且看到一个美国小孩与数码兽对话之后逃走的情况。巴达兽悄悄地尾随其后，得知这个小孩要去一个叫“花场”的地方寻找“夏天的回忆”。大家赶至那里。 收到小光的电子邮件的大辅他们马上坐飞机来到了美国......
优芙洛吉奴是一名出生于意大利的僵尸美少女。在某个暑假里，6名大学生在大学地下资料室中，拿走了属于她的“秘石”。 此后女仆阿鲁玛毫不留情地对着刚醒来仍睡眼惺忪的她说道：“小姐，请杀了学生们得到‘秘石’，否则身体将会崩坏殆尽”。 不得己之下，为求自保优芙洛吉奴只好大开杀戒，于是美少女僵尸VS女学生的杀戮游戏正式开幕了……
季节更替，第二个春天即将到来。 一个是劣等生的哥哥，一个是优等生的妹妹。两人在魔法科高校的生活即将结束第一学年。 达也和深雪利用春假，来到小笠原诸岛的一处别墅度假。 在短暂的休息中，达也一行人尽情放松。 然而，一个名叫九亜的少女突然出现在他们面前。这位从海军基地逃出来的少女向达也提出了一个请求……
距圣诞节仅有8天时间，SOS团在凉宫春日的号召下，不出意料地策划了一场圣诞狂欢派对。但就在12月18日这天早晨，阿虚却发现周围的世界有了些许变化。1年9班消失不见，朝比奈学姐视其形同路人，甚至早已死去的朝仓也代替凉宫春日坐在了阿虚的后面，而春日则如同人间蒸发一般无人知晓。当他冲向SOS团的教室时，只看到了孤零零坐在角落里看书的长门有希，一向淡定自若、冷如冰霜的长门大神也变成了怯懦害羞的乖乖女。从前一日长门留下的蛛丝马迹中，阿虚判断出这个世界似乎被某人重组了一番。 此时的阿虚，握有连接两个绝然不同世界的钥匙，他面临着重大的选择……
