摩尔庄园第二季一直探寻的谜底即将揭开？！天才少年RK突破重重阻力，一暗自调查父母的下落，却意外地发现正义基因的秘密！超人乐乐侠的真正身份就是菩提大伯收养的孩子——摩乐乐！更不可思议的是，摩乐乐体内的正义基因源自一场失败的实验，而参加这场实验的首席研究员竟然就是自己的父母！乐乐侠的身份险遭曝光！
1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。 11岁的少年八神太一（藤田淑子 配音），和伙伴石田大和（风间勇刀 配音）、武之内空（水谷优子 配音）、泉光子郎（天神有海 配音）、太刀川美美（前田爱 配音）、城户丈（菊池正美 配音）、高石武（小西寛子 配音）一起参加了夏令营，一次意外却被神秘地送到了一个多彩的数码世界。在那里，他们得到了叫做“数码宝贝”的搭档。进入数码世界后，八神太一一行人遇到了凶恶的怪兽贝壳兽，眼看大家都要被抓住的时候，太一的亚古兽忽然进化成为暴龙兽，拯救了他们。进化到底是怎么回事情？数码世界究竟是什么？无数的谜团出现在被召选的小朋友们面前，精彩的冒险就这样开始了……
陷入事业危机的猪猪侠拼尽全力想咸鱼翻身。事情因为他的努力而逐日改善，但不知不觉中，他已陷入黑暗乔伊的魔爪。 死灰复燃的黑暗乔伊失去了力量，如今，他为恢复自己的力量冒犯禁忌，不料错手放出被封印的魔物“时空魔像”。能够操纵时间和空间的两座魔像害世界大乱。猪猪侠和伙伴们为恢复世界和平与其展开死战。最终，猪猪侠成功消灭了敌人，但童话王国并未摆脱危机，因为黑暗乔伊竟把被打败的魔像吸入体内，获得远超过往的实力。尽管猪猪侠运用五灵王之力再次将他打败，但他还是逃进了异世界。 为彻底终结邪恶威胁，猪猪侠一行人决定远征异世界，誓要让童话王国永保和平。
