城北大学学生·筑波洋在练习滑翔机的时侯帮助了被不明组织追赶的改造工学者·志度博士。博士曾是与企图征服世界的组织·新修卡的合作者，但由于组织的残忍做法而令博士的良心受到谴责，从而选择逃离新修卡。洋为了匿藏博士而被新修卡的怪人打至垂死。博士为了救活洋而回到了新修卡，并把洋改造为改造人。 复活后的洋与博士一起逃离了新修卡。而为了保护人类，洋变身了，博士将变身后的洋称作“假面骑士”。
故事发生在遥远的宇宙，一个充满活力的领域--大智区，区内所有人都非常渴求知识，他们能从知识中汲取营养、增强智能，大智区内洋溢着一片详和安静的学习气氛。大智区内的小灵村有三名村民，分别是充满好奇心的小夫子、品性敦厚的蕃薯头及个性勇敢的小秦。三人是小灵村内比较活跃的伙伴，常常以自己的知识戏弄他人。老师字典长老帮助他们校正自己的言行。所有大智区的居民均以增进知识为终身目标，他们从知识中获取力量保护自己，保护大智区。三名主人公在学习的过程引发出一段段充满奇幻的冒险故事
