故事发生在解放战争时期。潜伏在国民党內部的中共地下党员马昀飞（于震 饰）被任命为国防部特勤组长，带人到东京押解南京大屠杀的元凶石岩夫（刘文治 饰）回国审判，不料一路上受到种种波折和阻挠，里面有军国主义的死硬分子，也有隐藏在军委会的汉奸高官。特勤小组在马昀飞带领下，始终将民族大义和国家利益放在首位，沖破各种艰难困苦，终于将战犯押解至南京法庭，并捎带揭露出731细菌部队的骇人暴行。正当完成仼务准备归队，闻讯传来石岩夫旧部劫狱的消息，马昀飞再次飞赴一线，与其劫狱旧部展开搏杀，他的英勇行为连一直监视他的孟凡彬（黄俊鹏 饰）都感到由衷赞叹......
中国命运的决战》全景式、全方位展现了半个世纪前发生在中国大地上的革命与反革命、光明与黑暗两种命运、两个前途的殊死斗争，展现了中国共产党在世界斗争格局中的历史作用，着重描绘了中国共产党领导人民革命推翻反动统治，建立新中国，人民当家做主的艰难而辉煌的战斗历程，艺术地再现了无产阶级革命领袖的风采。 这部作品的突出特点是把中国命运的选择放在世界格局上写，突破了以前的创作局限，使人们加深对解放战争的胜利和新中国建立的伟大历史意义的理解，并带入了对中美关系发展的思考。同时根据电视剧的特点，以写高层决策为主、文戏为主的原则，为充分刻画历史巨人展开了篇幅。剧中涉及历史人物378名。毛泽东、周恩来、朱德、邓小平、蒋介石、张治中、斯大林、莫洛托夫、李宗仁、丘吉尔、江青、宋美龄、冈村宁次、东条英机、艾森豪威尔威尔、马歇尔、杜鲁门等上百位世界知名人物亮相登场。
